Proteomics fokuserer på den dynamiske beskrivelsen av genregulering, kvantitativ bestemmelse av proteinnivåer av genuttrykk, identifisering av effekten av sykdommer og legemidler på livsprosesser, og forklaring på mekanismen for genuttrykksregulering. Som vitenskap er proteomics forskning ikke fra null I utgangspunktet er det en forlengelse av proteinprofilen (peptid) og genproduktkartleggingsteknologi som har vært brukt i mer enn 20 år. Peptidkartlegging er avhengig av todimensjonal gelelektroforese (2-DE) og ytterligere bildeanalyse; og gen Produktprofilen avhenger av en rekke analyser etter separasjon, for eksempel massespektrometri, aminosyresammensetningsanalyse, etc.
På grunn av eksistensen av variabel redigering og RNA-redigering, kan mange gener uttrykke en rekke forskjellige proteiner. Derfor er kompleksiteten i proteomet mye høyere enn genomets kompleksitet.
Hvis hele genomsekvensen av en art har blitt dechiffrert, betyr det ikke at proteomet til den arten også har blitt dechiffrert. Den spesifikke analysen av proteinproduktet av et gen bør bestemmes ved å fullstendig modifisere og regulere genomnivået, transkripsjonsnivået og oversettelsesnivået.